Rize Üniversitesi İlahiyat Fakültesi, 03.07.1992 gün ve 3837 sayılı kanunla Karadeniz Teknik Üniversitesi’ne bağlı olarak kurulmuş olup, 1993-1994 Eğitim-Öğretim yılında Temel İslam Bilimleri, Felsefe ve Din Bilimleri ile İslam Tarihi ve Sanatları olmak üzere üç akademik bölümle eğitim öğretime başlamıştır. Bu tarihten 2000-2001 eğitim öğretim yılına kadar, İl Özel İdaresi’ne tahsisli olup Rektörlük tarafından kiralanan 745 m2 arsa üzerindeki bina ile, yine İl Özel İdare Binası’nın 3. katındaki ek dersliklerde hizmet vermiştir. 2001-2002 eğitim öğretim yılından itibaren ise eğitim-öğretimine, Maliye Bakanlığı Milli Emlak Genel Müdürlüğü tarafından Üniversitemize tahsis edilen Rize İli, Merkez İlçesi, Müftü Mahallesi’nde bulunan 30 pafta, 193 ada, 3. Parseldeki Binası’nda 2016 yılına kadar eğitim-öğretime devam etmiştir. 
       2015 yılının Şubat ayında Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi Zihni Derin Yerleşkesinde temeli atılan yeni fakültemiz, 18 ay gibi kısa bir sürede tamamlanarak 2016 yılının Ekim ayında açılı gerçekleştirilmiştir. 65 milyon liraya mâl olan ve 24.335,71 m2'lik kapalı alana sahip yeni eğitim binamızın açılışı Cumhurbaşkanımız Sayın Recep Tayyip ERDOĞAN, eşi Emine ERDOĞAN Hanımefendi ile TBMM Başkanı İsmail KAHRAMAN ve beraberindekiler tarafından gerçekleştirilmiştir. Geleneksel mimari ile modern mimariyi mezceden ve 2016-2017 eğitim-öğretim yılında hizmete açılan yeni fakültemizde dekanlık, 95 akademisyen odası, 44 derslik, 250 kişilik konferans salonu, 40 bin kitaplı kütüphane, 2 hafızlık odası, tezhip, ebru, hat atölyeleri ve 150 araçlık kapalı otopark yer almaktadır.
       Fakültenin eğitim-öğretimi için son derece önemli olan fakülte kütüphanesi kurma çalışmalarına ilk yıldan itibaren önem verilmiş olup; çeşitli kişi, kurum ve kuruluşların katkılarıyla kütüphane iyi bir konuma gelmiştir. 2018 yılı sonu itibarıyla Fakülte kütüphanesindeki kitap sayısı 33.166’e ulaşmıştır.
       1993–1994 eğitim-öğretim yılında 32 öğrenci ile eğitim öğretime başlayan fakültemiz, Yüksek Lisans ve Doktora öğrencileri ile birlikte öğrenci sayısı 2256’a ulaşmış olup Eğitim-Öğretim faaliyetine devam etmektedir. 1998 yılında ilk mezunlarını veren Fakültemiz, 2019 Yılı sonu itibarı ile  750 Erkek, 1260 Kız öğrenci olmak üzere toplam 2010 öğrenci mezun vermiştir.